利用微生物群促进肺部健康-凯时尊龙官网

2019年8月，美国能源部（doe）科学办公室向国家微生物组数据协作项目(nmdc)提供了1000万美元的资助，该项目的目标是通过提供多学科微生物组数据的开放访问和一套用于高级分析的生物信息学工具来支持研究社区。该奖项反映了在一系列生物体和环境中产生的关于微生物组的组成和功能的大量数据。虽然对人类肺部微生物组的研究已经落后于肠道微生物组的研究，但现在发现这两种微生物在肺部疾病和危重疾病中都发挥着重要作用。仍需要努力查明和解决在认识方面的差距，使微生物群成为预防和治疗疾病的目标。

在过去的二十年里,这种微生物群参与了一系列肺部疾病的发生和进展,包括那些长期认为有微生物参与的基本(如哮喘、慢性阻塞性肺疾病和囊性纤维化)和传统上认为是无菌的疾病(如特发性肺纤维化(ipf),急性呼吸窘迫综合征和肺癌)。举例来说，已充分证明了如果生命早期接触微生物，将对哮喘的易感性有长期影响。更令人惊讶的发现是，肺微生物群可以预测ipf的疾病进展，这种共生微生物群和宿主免疫系统之间的相互作用与肺部肿瘤的发展有关。现在是毋庸置疑的是，微生物组作为一种丰富的治疗靶点、诊断和预后疾病标志物的潜力巨大，但要在呼吸医学和重症监护领域实现这一潜力，仍需要对新的研究领域进行开发和探索。

第一代微生物组的研究是描述性的，使用16s rrna基因测序来描述疾病状态下的肠道和肺部微生物群。随着该领域的成熟, 研究的重点已转向体外和动物模型中的力学研究，以及对人类的纵向研究和随机对照试验，这使研究人员能够确定微生物组和宿主-微生物群的相互作用是如何随着时间的推移而改变，以及与疾病状态、治疗方法和临床结果有关。下一步是多中心、多学科的联合研究，包括探索种群和地理区域之间微生物群的变化，重点是标准化和数据共享。描述微生物群落的新方法(如纳米孔测序和所谓的文化学)以及整合和查询多组学数据为我们提供了一个机会，极大地扩展了我们对微生物群落组成和功能的知识。现在需要扩大研究范围，把目光从细菌转移到病毒组和真菌微生物群的作用上。

《柳叶刀呼吸医学》2019年10月第7卷第10期的两篇系列论文强调了在理解上的差距，并考虑了呼吸道疾病中微生物组研究的未来方向。charissa naidoo和他的同事专注于结核病中的微生物群。虽然与非传染性疾病相比，传染病在微生物组的研究中受到了一定程度的忽视，但初步证据表明，呼吸道和肠道的微生物群在结核病的发病机制、治疗和临床结果中发挥了作用。结核病治疗对人类微生物群多样性具有长期影响，对患者在治疗期间和治疗结束后的康复具有健康影响。在第二篇论文中，kurtis budden和他的同事综述了微生物与宿主免疫相互作用的机制，它们在慢性呼吸系统疾病的发病和恶化中的作用，以及它们与常见疗法的相互作用。这些作者提出的下一步将是确定因果关系方向和理解该领域研究结果的临床意义的关键。

微生物群落越来越被认为是疾病过程和治疗反应中个体间差异的一个来源。在治疗试验中，微生物组现在应该被认为是患者异质性的一个重要组成部分。随着数据的不断积累，挑战将是如何将研究结果转化为临床干预措施，以改善健康结果。我们正处于精确医学的新时代的尖端，在这个时代，微生物群告知诊断、预后和治疗的风险分层，是新的治疗方法的目标。

1、有关微生物组数据协作的更多信息，请参见  

      https://microbiomedata.org/

2、有关肠道微生物的更多信息，请参见《自然》

      2019;568:499 - 504

3、有关微生物组和危重疾病的更多信息，请参见《柳叶刀呼

      吸医学》2016年综述;4:59 - 72

4、有关ipf中微生物组的更多信息，请参见am j respir crit 

      care med 2019;199:1127 - 38

5、有关肺癌局部微生物群的更多信息，请参见《细胞

      2019》;176:998 - 1013

6、有关数据共享的更多信息，请参见

      http://www.humanmicrobiome.org/

7、更多关于精确呼吸医学和微生物组见《柳叶刀呼吸医学

      2016》综述;4:73 - 82

8、原文链接

     2600(19)30307-8/fulltext